由于接二连三发生离奇事件，泊进之介和诗岛雾子奉命来到天空寺，希望作为目击证人的月村明里（大泽光 饰）和天空寺尊（西铭骏 饰）能协助弄清事件背后的真相。而当他们抵达天空寺的时候，却发现尊正和眼魔陷入苦战。进之介化身为假面骑士Ghost加入战斗，就在此时时空不知被什么扭曲，进之介和尊瞬间回到了十年前。在那里，天空寺尊看到了本应去世的父亲龙（西村和彦 饰）和孩童时候的自己。另一方面，由于两人误入时空乱流的缘故，当下时间里本应该被假面骑士Drive消灭的Roidmude再度复活。为了阻止恶魔的进犯，假面骑士Specter、Mach、Chaser相继出现，与对手展开了一场正邪大较量。谁曾想复活后的Roidmude实力空前强大，尊和进之介如果不能及时返回本来的世界，人类必将面临灭亡的危险。但是尊发现父亲马上要被敌人夺去性命，他决心留在过去改变父亲的命运。
殊不知，自己正一步步走入世纪天才里昂纳多·达芬奇精心布置的陷阱之中……
